En ce qui concerne l’hydrographie, le département est traversé d’est en ouest par l’Isère (286,1 km jusqu’au Rhône) et l’Arc (127,5 km), qui prennent leur source près du col de l’Iseran. L’Isère descend la vallée de la Tarentaise et l’Arc celle de la Maurienne après laquelle il rejoint l’Isère au niveau de la combe de Savoie. Ce sont les deux seuls cours d’eau de plus de 100 km en Savoie mais la longueur totale des cours d’eau dans le département s’établit à 2 200 km. Ses deux principales étendues d’eau sont le lac du Bourget (de 44,5 km², le plus grand et le plus profond lac naturel d’origine glaciaire français situé exclusivement en France) et le lac d’Aiguebelette (5,45 km²), l’un des moins pollués de France en raison d’un arrêté préfectoral de 1976 interdisant l’usage de bateaux à moteur thermique (à l’exception des services de secours) sur le lac. L’eau représente un total de 12 569 hectares, dont 8 000 de lacs.
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