Anjouan est desservie par voie aérienne grâce à l’aérodrome d’Anjouan-Ouani. L’île d’Anjouan possède de grandes plages de sable noir et très peu de sable blanc, donc le tourisme y est par rapport au reste de l’archipel résiduel, néanmoins les sites touristiques d’Anjouan sont :
La citadelle de Mutsamudu, le marché de la ville ;
Le mausolée du président Ahmed Abdallah à Domoni ;
Le parc du Mont Ntringui qui inclut le lac Dzialandze et le mont Ntringui ;
La région de Sima où se trouvent de nombreuses exploitations de plantes à parfum qui donnent leur surnom aux îles des Comores ;
Les chutes de Tratringa, à Bambao Mtrouni et la rivière du même nom ;
La plage de Moya et le col du même nom que les enfants dévalent sur des caisses à savon ;
La rivière de Jomani et le Cap Mangeat à l’entrée de Domoni ;
La cascade Tratringua a Ongoni-Marahani ;
Le mur de Momoni (uhura wa muji) à Domoni ;
Foumbani : plage de sable gris mélangé de galets et une série de petites criques dans les cratères ;
Maraharé, Vassi, Vouani : Ces zones offrent de grandes plages de sable gris et de galets, et situées en bordure de la route nationale ;
Lingoni : Ce village se situe à 4 km du littoral (Pomoni), point de départ ou d’arrivée de randonnée dans le sud en liaison avec le lac Dzialandzé et Dindri ;
Moya : De très belles criques de sable clair sont situées en contrebas du village ;
Chiroroni : situé au sud de l’île, elle est dotée d’une plage de sable brun mélangé de galets, l’ accès vers la plage est difficile
Ile de la Selle : l’Ile dispose de belles plages de sable blanc avec de l’eau claire, accessible par mer depuis le village de « Bimbini » ou à pied par grande marée basse.