La position géographique de la région de Béni Mellal-Khénifra, lui confère une diversité climatique qui varie d’un climat humide (sommets de la chaîne du Haut Atlas et certains pics du moyen Atlas) à un climat sub-aride en contrebas des massifs montagneux.
Le climat dominant est de type continental : froid intense en hiver avec des étés très chauds.
Par ailleurs, la pluviométrie moyenne annuelle connaît d’importantes variations. En 2012, la province de Béni Mellal enregistre des précipitations de l’ordre de 291 mm souvent mal réparties le long de l’année, un chiffre qui diminue d’année en année (il était de l’ordre de 460,3 mm en 2008) et qui se trouve à l’origine de certaines catastrophes telles que les inondations et l’affaissement de terrains et l’effondrement de vielles maisons; la province d’Azilal quant à elle, enregistre une pluviométrie de 450 mm avec des chutes de neige assez importantes, ce qui contribue à l’amélioration des volumes d’eau des retenues. Alors que Khouribga et Kasba Tadla enregistrent respectivement 278 mm 334 mm.
Les températures moyennes annuelles varient entre des maximales de 40°C dans la province de Béni-Mellal et minimales de 2°C dans la province d’Azilal.
La neige apparaît à partir de 900m d’altitude et le vent dominant est le chergui en période d’été.
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