Le Manitoba a un climat continental extrême. Les températures et les précipitations diminuent généralement du sud au nord et augmentent d’est en ouest. Le Manitoba est loin des influences modératrices des chaînes de montagnes ou des grands plans d’eau. En raison du paysage généralement plat, il est exposé aux masses d’air froid arctique à haute pression du nord-ouest en janvier et février. En été, des masses d’air sortent parfois du sud des États-Unis, car l’air chaud et humide est aspiré vers le nord depuis le golfe du Mexique. Les températures dépassent 30 °C plusieurs fois chaque été, et la combinaison de la chaleur et de l’humidité peut amener la valeur humidex au milieu des années 40. Carman, au Manitoba, a enregistré le deuxième humidex le plus élevé jamais enregistré au Canada en 2007, avec 53,0. Selon Environnement Canada, le Manitoba s’est classé au premier rang pour le ciel le plus clair toute l’année et au deuxième rang pour le ciel le plus clair en été et la province la plus ensoleillée en hiver et au printemps.
Le sud du Manitoba (y compris la ville de Winnipeg) fait partie de la zone climatique continentale humide (Köppen Dfb). Cette région est froide et venteuse en hiver et a souvent des blizzards en raison du paysage ouvert. Les étés sont chauds avec une durée modérée. Cette région est la zone la plus humide des provinces des Prairies, avec des précipitations modérées. Les étés sont chauds avec une durée modérée. Cette région est la zone la plus humide des provinces des Prairies, avec des précipitations modérées. Le sud-ouest du Manitoba, bien que sous la même classification climatique que le reste du sud du Manitoba, est plus proche de l’intérieur semi-aride du triangle de Palliser. La région est plus sèche et plus sujette aux sécheresses que d’autres parties du sud du Manitoba. Cette région est froide et venteuse en hiver et connaît de fréquents blizzards en raison de l’ouverture du paysage des Prairies canadiennes. Les étés sont généralement chauds, avec une humidité faible à modérée.
Les parties sud de la province, juste au nord de l’allée des tornades, subissent des tornades, avec 16 touchés confirmés en 2016. En 2007, les 22 et 23 juin, de nombreuses tornades se sont abattues, la plus grande une tornade F5 qui a dévasté des parties d’Elie (la plus forte tornade enregistrée au Canada).
Les sections nord de la province (y compris la ville de Thompson) se situent dans la zone climatique subarctique ( classification climatique de Köppen Dfc ). Cette région présente des hivers longs et extrêmement froids et des étés brefs et chauds avec peu de précipitations. Des températures nocturnes aussi basses que -40 ° C se produisent plusieurs jours chaque hiver.
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