La plupart des précipitations en Égypte tombent pendant les mois d’hiver. Au sud du Caire, les précipitations ne sont en moyenne que de 2 à 5 mm par an et à intervalles de plusieurs années. Sur une très fine bande de la côte nord, les précipitations peuvent atteindre 410 mm, principalement entre octobre et mars. La neige tombe sur les montagnes du Sinaï et sur certaines villes côtières du nord telles que Damiette, Baltim et Sidi Barrani, et rarement à Alexandrie. Une très petite quantité de neige est tombée sur le Caire le 13 décembre 2013, pour la première fois depuis plusieurs décennies. Le gel est également connu au milieu du Sinaï et au milieu de l’Égypte.
L’Égypte a un climat exceptionnellement chaud, ensoleillé et sec. Les températures moyennes élevées sont élevées dans le nord mais très élevées à extrêmement élevées dans le reste du pays en été. Les vents méditerranéens plus frais soufflent constamment sur la côte nord de la mer, ce qui contribue à obtenir des températures plus modérées, en particulier au plus fort de l’été. Le Khamaseen est un vent chaud et sec qui provient des vastes déserts du sud et souffle au printemps ou au début de l’été. Il apporte du sable brûlant et des particules de poussière, et amène généralement des températures diurnes supérieures à 40 °C et parfois supérieures à 50 °C à l’intérieur, tandis que l’humidité relative peut descendre jusqu’à 5 %, voire moins.
Avant la construction du barrage d’Assouan, le Nil était en crue chaque année, reconstituant ainsi le sol égyptien. Cela a donné à l’Égypte une récolte constante au fil des années.
L’élévation potentielle du niveau de la mer due au réchauffement climatique pourrait menacer la bande côtière densément peuplée de l’Égypte et avoir de graves conséquences sur l’économie, l’agriculture et l’industrie du pays. Conjuguée à des pressions démographiques croissantes, une élévation significative du niveau de la mer pourrait transformer des millions d’Égyptiens en réfugiés environnementaux d’ici la fin du 21e siècle, selon certains experts climatiques.
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