El turismo en Iquitos incluye un promedio entre más de 100 mil a 40 mil turistas anualmente, y el cual espera ascender rápidamente en los próximos años con los vuelos internacionales, y ser el hogar oficial y conmemorativo de la cuenca amazónica. Nombrada como la Capital Ecológica del Mundo, los lugares turísticos importantes incluyen Barrio de Belén y su principal mercado; Plaza de Armas; Casa de Fierro; Ex Hotel Palace; Iglesia Matriz de Iquitos; Reserva Nacional Allpahuayo Mishana; Embarcadero Bellavista-Nanay; las comunidades étnicas ubicadas alrededor de la ciudad; el complejo turístico y zoológico de Quistococha; Mercado Artesanal de San Juan.
La ciudad también es hogar de empresas turísticas únicas como Otorongo Expeditions, Amazon Golf Course, Project Amazonas (dedicada a la investigación y conservación) y Emperador Terraza. Experiencias especiales fuera de las zonas turísticas principales de la ciudad incluyen la Isla de los Monos, el mariposario Pilpintuwasi, el Fundo Pedrito (una granja de caimanes, paiches y pirañas), el circuito Iquitos-Zungarococha-Corrientillos-King Kong-Nina Rumi, y los distritos adyacentes Mazán, Indiana y Bellavista.
El misticismo, incluyendo el chamanismo, es otro de las atracciones dentro de su industria turística, el cual incluye de forma importante a la ayahuasca. La bebida es objeto de estudio e investigación por varios turistas occidentales.
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