Le Bénin est une bande de terre nord-sud en Afrique de l’Ouest située entre les latitudes 6° et 13°N et les longitudes 0° et 4°E. Il est délimité par le Togo à l’ouest, le Burkina Faso et le Niger au nord, le Nigeria à l’est et le golfe du Bénin au sud. La distance entre le fleuve Niger au nord et l’océan Atlantique au sud est d’environ 650 km. Bien que le littoral mesure 121 km, le pays mesure environ 325 km à son point le plus large. Quatre écorégions terrestres se trouvent à l’intérieur des frontières du Bénin : les forêts de l’est de la Guinée, les forêts de plaine du Nigeria, la mosaïque de forêt-savane guinéenne et la savane soudanienne occidentale. Il a obtenu un score moyen de 5,86/10 pour l’indice d’intégrité du paysage forestier en 2018, le classant au 93e rang mondial sur 172 pays.
Le Bénin présente une certaine variation d’altitude et peut être divisé en 4 zones du sud au nord, en commençant par la plaine côtière sablonneuse de basse altitude (altitude la plus élevée 10 m) qui mesure au plus 10 km de large. Elle est marécageuse et parsemée de lacs et de lagons communiquant avec l’océan. Derrière la côte se trouvent les plateaux du sud du Bénin couverts de mosaïques de forêt et de savane guinéenne (altitude comprise entre 20 et 200 m), divisés par des vallées s’étendant du nord au sud le long des rivières Couffo, Zou et Ouémé.
Cette géographie la rend vulnérable au changement climatique. La majorité du pays vivant près de la côte, dans des zones de basse altitude, l’élévation du niveau de la mer pourrait avoir des effets sur l’économie et la population. Les zones du nord verront d’autres régions devenir des déserts. Une zone de terrain plus plat parsemée de collines rocheuses dont l’altitude atteint 400 m s’étend autour de Nikki et Save.
Une chaîne de montagnes s’étend le long de la frontière nord-ouest et jusqu’au Togo ; ce sont l’Atacora. Le point culminant, le Mont Sokbaro, culmine à 658 m. Le Bénin possède des champs, des mangroves et des vestiges de forêts. Dans le reste du pays, la savane est couverte de maquis épineux et parsemée de baobabs. Certaines forêts bordent les berges des rivières. Au nord et au nord-ouest du Bénin, la Réserve du W du Niger et le Parc National de la Pendjari abrite des éléphants de brousse africaine, des lions, des antilopes, des hippopotames et des singes. Le parc national de la Pendjari ainsi que les parcs limitrophes de l’Arli et du parc national du W au Burkina Faso et au Niger comptent parmi les fiefs du lion en Afrique de l’Ouest ; avec environ 246 à 466 lions, le W-Arli-Pendjari abrite la plus grande population de lions restante en Afrique de l’Ouest. Historiquement, le Bénin a servi d’habitat au chien sauvage d’Afrique, une espèce en voie de disparition, Lycaon pictus ; on pense que ce canidé est localement éteint.
Les précipitations annuelles dans la zone côtière sont en moyenne de 1 300 mm. Le Bénin connaît 2 saisons des pluies et 2 saisons sèches par an. La principale saison des pluies s’étend d’avril à fin juillet, avec une période pluvieuse plus courte et moins intense de septembre à novembre. La principale saison sèche s’étend de décembre à avril, avec une saison sèche plus fraîche de juillet à septembre. Les températures et l’humidité sont plus élevées le long des côtes tropicales. À Cotonou, la température maximale moyenne est de 31 °C ; le minimum est de 24 °C.
Les variations de température augmentent en se déplaçant vers le nord à travers la savane et les plateaux vers le Sahel. Un vent sec du Sahara appelé Harmattan souffle de décembre à mars, lorsque l’herbe sèche, que les autres végétations deviennent brun rougeâtre et qu’un voile de fine poussière plane sur le pays, provoquant un ciel « couvert ». C’est aussi la saison où les agriculteurs brûlent les broussailles dans les champs.
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