Djibouti se trouve dans la Corne de l’Afrique, sur le golfe d’Aden et le Bab-el-Mandeb, à l’entrée sud de la mer Rouge. Il se situe entre les latitudes 11° et 14°N et les longitudes 41° et 44°E, au point le plus au nord de la vallée du Grand Rift. C’est à Djibouti que le fossé entre la plaque africaine et la plaque somalienne rencontre la plaque arabique, formant un tripoint géologique. L’interaction tectonique à ce tripoint a créé l’élévation la plus basse de n’importe quel endroit en Afrique au lac Assal, et la deuxième dépression la plus basse sur terre sèche partout sur terre (surpassée seulement par la dépression le long de la frontière de la Jordanie et d’Israël).
Le littoral du pays s’étend sur 314 kilomètres, avec un terrain composé principalement de plateaux, de plaines et de hautes terres. Djibouti a une superficie totale de 23 200 kilomètres carrés. Ses frontières s’étendent sur 575 km, dont 125 km sont partagés avec l’Érythrée, 390 km avec l’Éthiopie et 60 km avec le Somaliland. Djibouti est le pays le plus méridional de la plaque arabique.
Djibouti compte huit chaînes de montagnes avec des sommets de plus de 1 000 mètres. La chaîne de Mousa Alli est considérée comme la plus haute chaîne de montagnes du pays, avec le plus haut sommet à la frontière avec l’Éthiopie et l’Érythrée. Il a une altitude de 2 028 mètres. Le désert du Grand Bara couvre des parties du sud de Djibouti dans les régions d’Arta, d’Ali Sabieh et de Dikhil. La majorité se trouve à une altitude relativement basse, en dessous de 520 mètres.
Les points géographiques extrêmes comprennent :
La majeure partie de Djibouti fait partie de l’écorégion des brousses et prairies xériques éthiopiennes. L’exception est une bande orientale le long de la côte de la mer Rouge, qui fait partie du désert côtier érythréen.
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